Po skončení války se Egon Zill ukryl a změnil si jméno na „Willi Sonntag“. Avšak poté, co své pravé jméno zapsal do rodného listu svého nemanželského dítěte, byl Zill odhalen. Dne 26. srpna 1952 byl na Zilla vydán zatykač a po osmi měsících pátrání byl 24. dubna 1953 zatčen v Hamburku a předveden k západoněmeckému soudu. Podle poválečných vyšetřování mnichovské prokuratury Zill v Dachau mučil řadu vězňů a někteří z nich v důsledku týrání zemřeli. Svědci vypověděli, že Zill několikrát aktivně vyzýval k zabíjení vězňů nebo vraždy sám inicioval.