Dne 10. srpna 1945 byla zatčena a vyslýchána americkými vojáky. Byla popsána jako inteligentní, sofistikovaná a krutá zároveň. V roce 1946 byla vydána do Polska, kde byla souzena v osvětimském procesu, který začal 24. listopadu 1947 a trval jeden měsíc. Dne 22. prosince 1947 odsoudil polský Nejvyšší národní soud v Krakově Marii Mandl k trestu smrti oběšením. Její krutost byla v rozsudku znovu zdůrazněna: "Obviněná dokonce týrala vězeňkyně, které již byly jí samotnou určeny na smrt."