Přeživší z Osvětimi, Dr. Olga Lengyel, vzpomínala, jak Mengele s maximální péčí dohlížel na porod dítěte a do hodiny pak poslal matku i dítě do plynové komory. Při jiné příležitosti Mengele vytrhl dítě z matčina lůna a pak dítě hodil do pece. Nebyla to totiž dvojčata, jak doufal. V lednu 1945, kdy sovětská Rudá armáda postupovala západním Polskem, uprchl Mengele spolu s ostatními příslušníky SS z Osvětimi. Několik následujících měsíců strávil v koncentračním táboře Gross-Rosen a jeho pobočných táborech. V posledních dnech války si oblékl uniformu německé armády a připojil se k vojenské jednotce, která se po skončení války vzdala americkým vojenským silám.
