Celkem Stutthofem prošlo přibližně 100 000 vězňů, z nichž nejméně 60 000 zahynulo a dalších 22 000 bylo převezeno do jiných koncentračních táborů. Spravedlnost nakonec Johanna Paulse dostihla, když byl souzen v prvním stutthofském procesu, který začal 25. dubna 1946. Pauls i jeho nacističtí druhové se k obecnému obvinění z válečných zločinů vyjádřili, že jsou nevinní. Jeho bývalé kolegyně se prý během procesu chovaly nepřístojně, chichotaly se a žertovaly.
