Výpovědi o jeho pádu se značně liší. Historická shoda panuje v tom, že Chruščov připravil promyšlenou léčku a na 26. června svolal zasedání předsednictva, kde náhle zahájil ostrý útok na Beriju a obvinil ho, že je zrádce a špion placený britskou rozvědkou. Berija byl zcela zaskočen a zeptal se: "Co se děje, Nikito Sergejeviči? Co je to za nesmysly?" Když si Berija konečně uvědomil, co se děje, naléhavě žádal svého starého přítele Malenkova, aby promluvil v jeho prospěch. Malenkov mlčky svěsil hlavu a stiskl tlačítko na svém stole. To byl domluvený signál maršálu Georgijovi Žukovovi a skupině ozbrojených důstojníků v nedaleké místnosti, kteří vtrhli dovnitř a Beriju zatkli.
